Đại học Phú Yên là một trường đại học địa phương, đào tạo đa ngành, đa cấp, đáp ứng nhu cầu nhân lực phục vụ phát triển kinh tế - xã hội tỉnh Phú Yên và góp phần phát triển nguồn nhân lực của khu vực Nam Trung Bộ và Tây Nguyên. Đại học Phú Yên nơi ươm mầm tài năng trẻ.

Trường Đại học Phú Yên được thành lập theo Quyết định số 112/QĐ-TTg ngày 24/1/2007 của Thủ tướng Chính phủ trên cơ sở Trường Cao đẳng Sư phạm (CĐSP) và Trường Trung học Kinh tế – Kĩ thuật (THKT-KT) Phú Yên.

Tiền thân của Trường CĐSP Phú Yên là sự nối tiếp và phát triển các trường: Trường Sư phạm đồng bằng (1970), Trường Trung cấp Sư phạm Phú Yên (1975), Trường Trung học Sư phạm Phú Khánh (1976), Trường Trung học Sư phạm Phú Yên và Cơ sở Cao đẳng Sư phạm Phú Yên (1989), Trường Sư phạm Phú Yên (1990), Trường CĐSP Phú Yên (1995 – 2007).

Tiền thân của Trường THKT-KT Phú Yên là sự nối tiếp và phát triển các trường: Trường Nông nghiệp Hoà An (1975) và Trường Hợp tác hoá Nông nghiệp (1978), Trường Trung học Nông nghiệp Phú Khánh (1980), Trường Trung học Nông nghiệp Phú Yên (1989), Trường THKT-KT Phú Yên (1995 – 2007).

Trường Đại học Phú Yên có tổng diện tích 30 ha. Chủ yếu đã xây dựng trên diện tích cơ sở 1 đáp ứng quy mô đào tạo khoảng 5.000 SVHS. Tổng diện tích sàn 11.250 m2; trong đó, nhà học: 2.417 m 2, thư viện: 1.236 m2, giảng đường (200 chỗ): 298 m2, nhà học đặc thù: 981 m2, nhà tập đa chức năng: 940 m2, ký túc xá (800 chỗ): 2.668 m2, nhà ăn: 1.038 m2, 2 phòng thí nghiệm vật lý: 145 m2, 2 phòng thí nghiệm hoá: 145 m2, 2 phòng thí nghiệm sinh học: 145 m2, 3 phòng thực hành nhạc: 184 m2, 4 phòng thực hành vi tính: 245 m2, 1 phòng LAB: 49 m2.

Hệ thống ngành đào tạo của Trường Đại học Phú Yên chủ yếu thuộc các nhóm ngành: Sư phạm, Kỹ thuật – Công nghệ, Nông nghiệp, Kinh tế, Khoa học Xã hội – Nhân văn, Khoa học Tự nhiên và Ngoại ngữ. Đến năm học 2016 – 2017, trường có 13 mã ngành đại học, 7 mã ngành cao đẳng; quy mô đào tạo 2.841SVHS và học viên bao gồm tất cả các hệ, các loại hình đào tạo: chính quy, vừa làm vừa học, liên thông, liên kết.

Về đào tạo, đến năm 2020 mở được 30 ngành đại học, 5 ngành cao học, 2 ngành nghiên cứu sinh. Quy mô đào tạo, đến năm 2020: 15.000 SVHS, học viên; bao gồm các hệ, loại hình đào tạo: chính quy, vừa làm vừa học, liên thông, liên kết. Mở rộng quy mô và chỉ tiêu đào tạo theo hướng phát huy thế mạnh đào tạo sư phạm; ưu tiên phát triển đào tạo các ngành kinh tế, kĩ thuật – công nghệ, nông nghiệp và văn hoá – du lịch.

Về nghiên cứu khoa học, đến năm 2020 có khoảng 50 đề tài/năm; riêng giai đoạn 2015 – 2020, số đề tài cấp bộ, cấp tỉnh tăng 2 lần so với giai đoạn 2010 – 2015. Đến năm 2020, hình thành một số nhóm nghiên cứu có sự tham gia của các nhà khoa học nổi tiếng trong nước; có sản phẩm nghiên cứu được sử dụng cho việc xây dựng chiến lược phát triển kinh tế - xã hội của tỉnh Phú Yên, của khu vực Nam Trung Bộ và Tây Nguyên, giải quyết được các vấn đề đặt ra từ các doanh nghiệp và được giới học thuật trong nước đánh giá cao và tham khảo để nghiên cứu nối tiếp.